Dnia 2 stycznia 2006 roku ks. abp Stanisław Dziwisz podpisał statut oraz dekret powołujący do ťycia Centrum jako kościelną, publiczną osobę prawną podlegą bezpośrednio Metropolicie Krakowskiemu. W dekrecie powołującym zapisano słowa, ťe centrum powoływane jest dla upamiętnienia wielkiego dziedzictwa osoby i pontyfikatu sługi Boťego papieťa Jana Pawła II oraz po to aby jego przykład i słowo zostały przekazane następnym pokoleniom. Nazwa Centrum - Nie lękajcie się – została uťyta w celu nawiązania do pamiętnych słów Ojca Źwiętego wypowiedzianych w październiku 1978 r. podczas inauguracji pontyfikatu: Nie lękajcie się. Otwórzcie, otwórzcie na ościeť drzwi Chrystusowi! Jego zbawczej władzy. Otwórzcie granice państw, systemów ekonomicznych, systemów politycznych, kierunków cywilizacyjnych. Nie lękajcie się!.
http://www.centrum.janpawel2.pl